Mezobotoksta farklı uygulanma protokolleri kullanılmaktadır. 

Protokol I

Yüksek botulinum toksin konsantrasyonu tercih edilmektedir. 100 U botulinum toxin 1ml serum fizyolojik ile sulandırılarak uygulanmaktadır.

Protokol II

Klasik botulinum toksin konsantrasyonu tercih edilmektedir. 100 U botulinum toxin 5ml serum fizyolojik + 0.15ml 2% lidokain ile sulandırılarak uygulanmaktadır.

Protokol III

Klasik botulinum toksin konsantrasyonuna göre daha sulandırılmış toksin konsantrasyonu tercih edilmektedir. 100 U botulinum toxin 7ml serum fizyolojik + 0.2 ml 2% lidokain ile sulandırılarak uygulanmaktadır.

Protokol IV

Daha yüksek sulandırılmış toksin konsantrasyonu tercih edilmektedir. Sıklıkla akne ve roza hastalıklarında ve genişlemiş cilt gözenekler için kullanılmaktadır. 100U botulinum toxin 10ml serum fizyolojik ile sulandırılarak uygulanmaktadır.